Джон Рой Андерсон появился на свет 25 октября 1944 года в Ланкашире, Англия. Музыкальную карьеру начал в группе своего брата Тони Warriors, с которой выступал пять лет и записал в 1965 году сингл, оставшийся без особого внимания. Поиграв какое-то время в коллективе The Party, в 1968 году Андерсон выпустил два сольных сингла под псевдонимом “Ганс Христиан Андерсен”, после чего на несколько месяцев оказался в ансамбле Gun. Тогда же, в 1968 году Андерсон (к тому времени известный в музыкальных кругах как “Йон”), познакомился в одном из лондонских клубов с Крисом Скуайром и начал выступать с его группой Mabel Greer’s Toy Shop, в которой вскоре появились Билл Браффорд, Тони Кей и Питер Бэнкс, вернувшийся после недолгого отсутствия. Сменив название на Yes , коллектив начал активно выступать и выпускать пластинки, место Бэнкса вскоре занял Стив Хоуи; позже появился Рик Уэйкман. Андерсон же, помимо работы в Yes, записывался и с другими музыкантами (King Crimson, Вангелис, Джонни Харрис).
В конце 70х пути Андерсона и Yes разошлись, в 1980 он выпустил второй сольный альбом “Song of Seven” и “Short Stories”, записанный с Вангелисом. В следующем году вышло еще две их совместных пластинки, Андерсон поучаствовал в создании альбома Рика Уэйкмана “1984”, и год спустя записал очередной сольник “Animation”.
В 1983 году бывшие соратники по Yes Крис Скуайр и Алан Уайт пригласили Андерсона принять участие в записи пластинки их нового проекта Cinema, однако тот справедливо заметил, что с его вокалом это будет все тот же Yes, с чем согласились и остальные, и диск, озаглавленный “90125”, содержавший знаменитую “Owner of a Lonely Heart,” был издан, как работа Yes. После релиза группа отправилась в турне, затем наступил некоторой перерыв в ее деятельности, воспользовавшись которым Андерсон записал пластинку праздничных песен “Three Ships” и несколько саундтреков с Джон Пол Джонсом и Tangerine Dream. Выпустив еще один альбом с Yes, после гастролей он вторично покинул группу в 1987 году, но через некоторое время возобновил сотрудничество с частью музыкантов, в результате чего появилась пластинка “Anderson- Bruford-Wakeman-Howe” (название “Yes” юридически принадлежало Скуайру, не позволившему использовать его). Впоследствии оба состава Yes записали совместный альбом “Union”(1991).
В первой половине 90х Андерсон выпустил четыре сольных альбома, два альбома в содружестве с Вангелисом и очередную пластинку с Yes (” Talk”).
В конце 1995 года было объявлено, что коллектив возрождается в классическом составе, в марте следующего года квинтет выступил с несколькими концертами, результатом чего стал релиз “Keys to Ascension”, дополненный новым студийным материалом. Два года спустя Андерсон записал два новых сольных диска “Celtic The Promise Ring” и “EarthMotherEarth” и принял участие в работе над очередным творением Yes “Open Your Eyes”.
В 1998 году был издан “The More You Know”, в 2001 “Magnification”.