Екатерина Кулькова родилась в Екатеринбурге в 1984 году. Окончила Екатеринбургский музыкальный лицей по специальностям «композиция» и «теория музыки» в 2003. Окончила Московскую государственную консерваторию им. П. И. Чайковского по специальности «композиция» в 2008 году и аспирантуру в 2011 году под руководством профессора Ю. С. Каспарова, став первой из тех, кто окончил у него аспирантуру.